Page 26 - Necesidad y desarrollo de Fisioma, un concepto basado en Fisiología Integrativa

■ Para facilitar la comunicación entre grupos de investigación y en todos los niveles de abstracción, se emplea lenguaje de marcas extensible (XML) para el software, los módulos, enunciados matemáticos, modelos, etc. (como MathML, CellML, FieldML) y son necesarios lenguajes de programación apropiados (como Perl, Python o Matlab). El marco se denomina ModelML, y si se agregan ontologías específicas de dominio para vincularlo a entidades biológicas concretas (células, tejidos u órganos), el marco se extiende para convertirse en TissueML o AnatML.
■ Los conocimientos generados en lugares y por grupos diferentes se pondrán en común en el Proyecto y que todos los estándares de Fisioma son abiertos, el software usa “open source licensing” (licencia de fuente abierta) y todos los modelos y repositorios están accesibles en la red. En http://physiomeproject.org/software hay información actualizada.